교단은 성경을 믿는다는 큰 틀 안에서 무엇을 중요하게 보고, 교회를 어떻게 운영하며, 예배와 성례를 어떻게 이해하는지에 따라 나뉩니다. 대표적으로 다음 기준이 있습니다.

• 신학 전통: 장로교는 개혁주의 전통과 하나님의 주권을 강조하고, 감리교는 성화와 인간의 응답을 더 강조하는 경향이 있으며, 침례교는 개인의 신앙고백과 신자의 세례를 중요하게 봅니다.
• 교회 정치: 장로교는 장로 중심의 대의제, 감리교는 감독제, 침례교는 개교회 자치가 중심입니다.
• 세례 이해: 장로교는 언약 공동체의 표지로 유아세례를 인정하지만, 침례교는 스스로 신앙을 고백한 사람에게만 세례를 베풉니다.
• 성찬 이해: 장로교는 성찬에서 성령을 통한 그리스도와의 영적 교통을 강조합니다.
• 성령의 은사 이해: 오순절 계열은 방언과 신유 같은 은사를 오늘날에도 적극적으로 강조하는 편이며, 다른 교단들은 은사의 지속 여부와 예배에서의 역할을 다르게 봅니다.

성경은 교단 이름보다 복음의 진리와 교회의 거룩함을 더 본질적인 문제로 다룹니다. 동시에 교단의 차이가 전혀 중요하지 않은 것은 아닙니다. 세례, 성찬, 교회 권위, 구원과 성령의 은사에 대한 이해가 실제 신앙생활을 바꾸기 때문입니다. 장로교는 성경의 최종 권위를 인정하며, 하나님의 주권과 말씀 중심의 예배를 핵심으로 삼습니다. (에베소서 4:4-6, 고린도전서 1:10)